Organisasi Siswa Intra Madrasah (OSIM) merupakan wadah organisasi resmi bagi peserta didik di MTs Negeri 1 Batam yang berfungsi sebagai sarana pembinaan kepemimpinan, tanggung jawab, serta pengembangan sikap sosial dan kepribadian siswa. OSIM dibentuk untuk melatih siswa agar mampu berorganisasi dengan baik, bekerja sama, serta berperan aktif dalam mendukung terciptanya lingkungan belajar yang harmonis dan dinamis di MTs Negeri 1 Batam.
Di MTs Negeri 1 Batam, OSIM berada dalam pembinaan Wakil Kepala Madrasah Bidang Kesiswaan serta didukung oleh para pembina kegiatan siswa. Keberadaan OSIM menjadi bagian penting dalam pelaksanaan program kesiswaan, karena berperan sebagai penggerak berbagai aktivitas yang berkaitan dengan pengembangan minat, bakat, dan karakter peserta didik, baik dalam bidang kepemimpinan, keagamaan, seni, olahraga, maupun kegiatan sosial.
Melalui berbagai aktivitas organisasi yang terarah, OSIM di MTs Negeri 1 Batam bertujuan menumbuhkan sikap disiplin, jiwa kepemimpinan, rasa tanggung jawab, serta semangat kebersamaan antar siswa. Seluruh pelaksanaan kegiatan OSIM senantiasa diselaraskan dengan visi dan misi MTs Negeri 1 Batam, yaitu mewujudkan peserta didik yang unggul dalam prestasi serta berlandaskan iman dan takwa. Dengan dukungan seluruh warga madrasah, OSIM diharapkan mampu menjadi sarana pembelajaran organisasi yang positif dan bermanfaat bagi perkembangan peserta didik.